Physicochemical characterisation of dihydro-alpha-lipoic acid interaction with human serum albumin by multi-spectroscopic and molecular modelling approaches
Физичко-хемијска карактеризација интеракције дихидро-липоинске киселине и албумина из серума људи применом мулти-спектроскопских метода и молекулског моделовања
Authors
Gligorijević, Nikola
Šukalović, Vladimir

Minić, Simeon
Miljuš, Goran
Nedić, Olgica

Penezić, Ana

Article (Published version)
Metadata
Show full item recordAbstract
The binding of a popular food supplement and well-known antioxidant, dihydro-alpha-lipoic acid (DHLA) to human serum albumin (HSA) was characterised. The binding was monitored by several spectroscopic methods together with the molecular docking approach. HSA was able to bind DHLA with moderate affinity, 1.00±0.05×104 M-1. Spectroscopic data demonstrated that the preferential binding site for DHLA on HSA is IIA (Sudlow I). Both experimental and molecular docking analysis identified electrostatic (salt bridges) and hydrogen bonds as the key interactions involved in DHLA binding to HSA. Molecular docking confirmed that the Sudlow I site could accommodate DHLA and that the ligand is bound to the protein in a specific conformation. The molecular dynamic simulation showed that the formed complex is stable. Binding of DHLA does not affect the structure of the protein, but it thermally stabilises HSA. Bound DHLA had no effect on the susceptibility of HSA to trypsin digestion. Since DHLA is a c...ommonly used food supplement, knowledge of its pharmacokinetics and pharmacodynamic properties in an organism is very important. This study further expands it by providing a detailed analysis of its interaction with HSA, the primary drug transporter in the circulation.
У раду су описане карктеристике везивања дихидро-липоинске киселине (DHLA), познатог суплемента у исхрани и антиоксиданса, за албумин из серума људи (HSA). Процес везивања је праћен применом већег броја спектроскопских метода и молекул-
ским моделовањем. HSA везује DHLA умереним афинитетом, 1,00±0,05×104 M-1. Спектроскопски резултати су показали да је везујуће место IIA (Sudlow I) главно место везивања DHLA за HSA. Експериментални, као и резултати молекулског моделовања, су идентификовали електростатичке (сони мостови) и водоничне везе као главне типове
интеракција. Резултати молекулског моделовања су потврдили да и место Sudlow I може везати DHLA, која је у том случају у специфичној конформацији. Симулација молекулске динамике је показала да је формирани комплекс стабилан. Везивање DHLA не
утиче на структуру протеина, али повећава његову термалну стабилност. Везани DHLA не утиче на подложност HSA трипсинској дигестији. Како је DHLA уобичајен суплемент у исхрани, знање о његовим фар...макоконетичким и фармакодинамичким особинама је веома важно. Ово испитивање допуњује досадашња знања детаљном анализом интеракције DHLA са HSA, примарним транспортним протеином лекова у циркулацији.
Keywords:
Molecular docking / Protein stability / Protein structure / Protein-ligand interaction / Spectral analysisSource:
Journal of the Serbian Chemical Society, 2021, 86, 9, 795-807Publisher:
- Belgrade : Serbian Chemical Society
Funding / projects:
- Ministry of Education, Science and Technological Development, Republic of Serbia, Grant no. 200019 (University of Belgrade, Institute for the Application of Nuclear Energy - INEP) (RS-200019)
- Ministry of Education, Science and Technological Development, Republic of Serbia, Grant no. 200026 (University of Belgrade, Institute of Chemistry, Technology and Metallurgy - IChTM) (RS-200026)
- Ministry of Education, Science and Technological Development, Republic of Serbia, Grant no. 200168 (University of Belgrade, Faculty of Chemistry) (RS-200168)
DOI: 10.2298/JSC210420041G
ISSN: 0352-5139
WoS: 000692558700002
Scopus: 2-s2.0-85114223943
Collections
Institution/Community
IHTMTY - JOUR AU - Gligorijević, Nikola AU - Šukalović, Vladimir AU - Minić, Simeon AU - Miljuš, Goran AU - Nedić, Olgica AU - Penezić, Ana PY - 2021 UR - https://cer.ihtm.bg.ac.rs/handle/123456789/4763 AB - The binding of a popular food supplement and well-known antioxidant, dihydro-alpha-lipoic acid (DHLA) to human serum albumin (HSA) was characterised. The binding was monitored by several spectroscopic methods together with the molecular docking approach. HSA was able to bind DHLA with moderate affinity, 1.00±0.05×104 M-1. Spectroscopic data demonstrated that the preferential binding site for DHLA on HSA is IIA (Sudlow I). Both experimental and molecular docking analysis identified electrostatic (salt bridges) and hydrogen bonds as the key interactions involved in DHLA binding to HSA. Molecular docking confirmed that the Sudlow I site could accommodate DHLA and that the ligand is bound to the protein in a specific conformation. The molecular dynamic simulation showed that the formed complex is stable. Binding of DHLA does not affect the structure of the protein, but it thermally stabilises HSA. Bound DHLA had no effect on the susceptibility of HSA to trypsin digestion. Since DHLA is a commonly used food supplement, knowledge of its pharmacokinetics and pharmacodynamic properties in an organism is very important. This study further expands it by providing a detailed analysis of its interaction with HSA, the primary drug transporter in the circulation. AB - У раду су описане карктеристике везивања дихидро-липоинске киселине (DHLA), познатог суплемента у исхрани и антиоксиданса, за албумин из серума људи (HSA). Процес везивања је праћен применом већег броја спектроскопских метода и молекул- ским моделовањем. HSA везује DHLA умереним афинитетом, 1,00±0,05×104 M-1. Спектроскопски резултати су показали да је везујуће место IIA (Sudlow I) главно место везивања DHLA за HSA. Експериментални, као и резултати молекулског моделовања, су идентификовали електростатичке (сони мостови) и водоничне везе као главне типове интеракција. Резултати молекулског моделовања су потврдили да и место Sudlow I може везати DHLA, која је у том случају у специфичној конформацији. Симулација молекулске динамике је показала да је формирани комплекс стабилан. Везивање DHLA не утиче на структуру протеина, али повећава његову термалну стабилност. Везани DHLA не утиче на подложност HSA трипсинској дигестији. Како је DHLA уобичајен суплемент у исхрани, знање о његовим фармакоконетичким и фармакодинамичким особинама је веома важно. Ово испитивање допуњује досадашња знања детаљном анализом интеракције DHLA са HSA, примарним транспортним протеином лекова у циркулацији. PB - Belgrade : Serbian Chemical Society T2 - Journal of the Serbian Chemical Society T1 - Physicochemical characterisation of dihydro-alpha-lipoic acid interaction with human serum albumin by multi-spectroscopic and molecular modelling approaches T1 - Физичко-хемијска карактеризација интеракције дихидро-липоинске киселине и албумина из серума људи применом мулти-спектроскопских метода и молекулског моделовања VL - 86 IS - 9 SP - 795 EP - 807 DO - 10.2298/JSC210420041G ER -
@article{ author = "Gligorijević, Nikola and Šukalović, Vladimir and Minić, Simeon and Miljuš, Goran and Nedić, Olgica and Penezić, Ana", year = "2021", abstract = "The binding of a popular food supplement and well-known antioxidant, dihydro-alpha-lipoic acid (DHLA) to human serum albumin (HSA) was characterised. The binding was monitored by several spectroscopic methods together with the molecular docking approach. HSA was able to bind DHLA with moderate affinity, 1.00±0.05×104 M-1. Spectroscopic data demonstrated that the preferential binding site for DHLA on HSA is IIA (Sudlow I). Both experimental and molecular docking analysis identified electrostatic (salt bridges) and hydrogen bonds as the key interactions involved in DHLA binding to HSA. Molecular docking confirmed that the Sudlow I site could accommodate DHLA and that the ligand is bound to the protein in a specific conformation. The molecular dynamic simulation showed that the formed complex is stable. Binding of DHLA does not affect the structure of the protein, but it thermally stabilises HSA. Bound DHLA had no effect on the susceptibility of HSA to trypsin digestion. Since DHLA is a commonly used food supplement, knowledge of its pharmacokinetics and pharmacodynamic properties in an organism is very important. This study further expands it by providing a detailed analysis of its interaction with HSA, the primary drug transporter in the circulation., У раду су описане карктеристике везивања дихидро-липоинске киселине (DHLA), познатог суплемента у исхрани и антиоксиданса, за албумин из серума људи (HSA). Процес везивања је праћен применом већег броја спектроскопских метода и молекул- ским моделовањем. HSA везује DHLA умереним афинитетом, 1,00±0,05×104 M-1. Спектроскопски резултати су показали да је везујуће место IIA (Sudlow I) главно место везивања DHLA за HSA. Експериментални, као и резултати молекулског моделовања, су идентификовали електростатичке (сони мостови) и водоничне везе као главне типове интеракција. Резултати молекулског моделовања су потврдили да и место Sudlow I може везати DHLA, која је у том случају у специфичној конформацији. Симулација молекулске динамике је показала да је формирани комплекс стабилан. Везивање DHLA не утиче на структуру протеина, али повећава његову термалну стабилност. Везани DHLA не утиче на подложност HSA трипсинској дигестији. Како је DHLA уобичајен суплемент у исхрани, знање о његовим фармакоконетичким и фармакодинамичким особинама је веома важно. Ово испитивање допуњује досадашња знања детаљном анализом интеракције DHLA са HSA, примарним транспортним протеином лекова у циркулацији.", publisher = "Belgrade : Serbian Chemical Society", journal = "Journal of the Serbian Chemical Society", title = "Physicochemical characterisation of dihydro-alpha-lipoic acid interaction with human serum albumin by multi-spectroscopic and molecular modelling approaches, Физичко-хемијска карактеризација интеракције дихидро-липоинске киселине и албумина из серума људи применом мулти-спектроскопских метода и молекулског моделовања", volume = "86", number = "9", pages = "795-807", doi = "10.2298/JSC210420041G" }
Gligorijević, N., Šukalović, V., Minić, S., Miljuš, G., Nedić, O.,& Penezić, A.. (2021). Physicochemical characterisation of dihydro-alpha-lipoic acid interaction with human serum albumin by multi-spectroscopic and molecular modelling approaches. in Journal of the Serbian Chemical Society Belgrade : Serbian Chemical Society., 86(9), 795-807. https://doi.org/10.2298/JSC210420041G
Gligorijević N, Šukalović V, Minić S, Miljuš G, Nedić O, Penezić A. Physicochemical characterisation of dihydro-alpha-lipoic acid interaction with human serum albumin by multi-spectroscopic and molecular modelling approaches. in Journal of the Serbian Chemical Society. 2021;86(9):795-807. doi:10.2298/JSC210420041G .
Gligorijević, Nikola, Šukalović, Vladimir, Minić, Simeon, Miljuš, Goran, Nedić, Olgica, Penezić, Ana, "Physicochemical characterisation of dihydro-alpha-lipoic acid interaction with human serum albumin by multi-spectroscopic and molecular modelling approaches" in Journal of the Serbian Chemical Society, 86, no. 9 (2021):795-807, https://doi.org/10.2298/JSC210420041G . .