Synthesis of novel 2-(piperazino-1-yl-alkyl)-1H-benzimidazole derivates and assessment of their interactions with the D2 dopamine receptor
2019
Преузимање 🢃
Аутори
Penjišević, JelenaAndrić, Deana B.
Šukalović, Vladimir
Roglić, Goran
Šoškić, Vukić
Kostić Rajačić, Slađana
Чланак у часопису (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
A total of 14 novel arylpiperazines were synthesized, and pharmacologically evaluated by measuring their affinities towards the D2 dopamine receptor (DRD2) in a [3H]spiperone competition assay. All the herein described compounds consist of a benzimidazole moiety connected to N-(2-methoxyphenyl)piperazine via linkers of various lengths. Molecular docking analysis and molecular dynamics simulations were performed on the DRD2–arylpiperazine complexes with the objective of exploring the receptor–ligand interactions and properties of the receptor binding site. The recently published crystal structure of DRD2 was used throughout this study. The major finding is that high affinity arylpiperazines must interact with both the orthosteric binding site and the extended binding pocket of DRD2 and therefore should contain a linker of 5 or 6 methylene groups long
У овом раду је презентована синтеза 14 нових арилпиперазина и одређен је њихов
афинитет везивања за Д2 допамински рецептор (DRD2) тестовима компетиције са
[3H]спипероном. По својој хемијској структури ова једињења представљају супституисане
бензимидазоле повезане са N-(2-метоксифенил)пиперазинским делом, линкерима разли-
читих дужина. У циљу испитивања лиганд-рецептор интеракција и особина везивног места
DRD2, урађена је докинг анализа новосинтетисаних једињења и симулација молекулске
динамике, користећи кристалну структуру рецептора. Резултати добијени у овом раду
указују да арилпиперазини високог афинитета остварују интеракције у ортостерном везивном месту и у екстензији ортостерног места везивања DRD2 и да стога треба да поседују
линкер оптималне дужине, од 5 или 6 метиленских група.
Кључне речи:
arylpiperazines / molecular dynamics / molecular docking / receptor binding siteИзвор:
Journal of the Serbian Chemical Society, 2019, 84, 9, 925-934Издавач:
- Beograd : Srpsko hemijsko društvo
Финансирање / пројекти:
- Проучавање односа структуре и активности новосинтетисаних биолошки активних супстанци (RS-MESTD-Basic Research (BR or ON)-172032)
DOI: 10.2298/JSC181029104P
ISSN: 0352-5139; 1820-7421
WoS: 000489023300001
Scopus: 2-s2.0-85073035002
Институција/група
IHTMTY - JOUR AU - Penjišević, Jelena AU - Andrić, Deana B. AU - Šukalović, Vladimir AU - Roglić, Goran AU - Šoškić, Vukić AU - Kostić Rajačić, Slađana PY - 2019 UR - https://cer.ihtm.bg.ac.rs/handle/123456789/3316 AB - A total of 14 novel arylpiperazines were synthesized, and pharmacologically evaluated by measuring their affinities towards the D2 dopamine receptor (DRD2) in a [3H]spiperone competition assay. All the herein described compounds consist of a benzimidazole moiety connected to N-(2-methoxyphenyl)piperazine via linkers of various lengths. Molecular docking analysis and molecular dynamics simulations were performed on the DRD2–arylpiperazine complexes with the objective of exploring the receptor–ligand interactions and properties of the receptor binding site. The recently published crystal structure of DRD2 was used throughout this study. The major finding is that high affinity arylpiperazines must interact with both the orthosteric binding site and the extended binding pocket of DRD2 and therefore should contain a linker of 5 or 6 methylene groups long AB - У овом раду је презентована синтеза 14 нових арилпиперазина и одређен је њихов афинитет везивања за Д2 допамински рецептор (DRD2) тестовима компетиције са [3H]спипероном. По својој хемијској структури ова једињења представљају супституисане бензимидазоле повезане са N-(2-метоксифенил)пиперазинским делом, линкерима разли- читих дужина. У циљу испитивања лиганд-рецептор интеракција и особина везивног места DRD2, урађена је докинг анализа новосинтетисаних једињења и симулација молекулске динамике, користећи кристалну структуру рецептора. Резултати добијени у овом раду указују да арилпиперазини високог афинитета остварују интеракције у ортостерном везивном месту и у екстензији ортостерног места везивања DRD2 и да стога треба да поседују линкер оптималне дужине, од 5 или 6 метиленских група. PB - Beograd : Srpsko hemijsko društvo T2 - Journal of the Serbian Chemical Society T1 - Synthesis of novel 2-(piperazino-1-yl-alkyl)-1H-benzimidazole derivates and assessment of their interactions with the D2 dopamine receptor VL - 84 IS - 9 SP - 925 EP - 934 DO - 10.2298/JSC181029104P ER -
@article{ author = "Penjišević, Jelena and Andrić, Deana B. and Šukalović, Vladimir and Roglić, Goran and Šoškić, Vukić and Kostić Rajačić, Slađana", year = "2019", abstract = "A total of 14 novel arylpiperazines were synthesized, and pharmacologically evaluated by measuring their affinities towards the D2 dopamine receptor (DRD2) in a [3H]spiperone competition assay. All the herein described compounds consist of a benzimidazole moiety connected to N-(2-methoxyphenyl)piperazine via linkers of various lengths. Molecular docking analysis and molecular dynamics simulations were performed on the DRD2–arylpiperazine complexes with the objective of exploring the receptor–ligand interactions and properties of the receptor binding site. The recently published crystal structure of DRD2 was used throughout this study. The major finding is that high affinity arylpiperazines must interact with both the orthosteric binding site and the extended binding pocket of DRD2 and therefore should contain a linker of 5 or 6 methylene groups long, У овом раду је презентована синтеза 14 нових арилпиперазина и одређен је њихов афинитет везивања за Д2 допамински рецептор (DRD2) тестовима компетиције са [3H]спипероном. По својој хемијској структури ова једињења представљају супституисане бензимидазоле повезане са N-(2-метоксифенил)пиперазинским делом, линкерима разли- читих дужина. У циљу испитивања лиганд-рецептор интеракција и особина везивног места DRD2, урађена је докинг анализа новосинтетисаних једињења и симулација молекулске динамике, користећи кристалну структуру рецептора. Резултати добијени у овом раду указују да арилпиперазини високог афинитета остварују интеракције у ортостерном везивном месту и у екстензији ортостерног места везивања DRD2 и да стога треба да поседују линкер оптималне дужине, од 5 или 6 метиленских група.", publisher = "Beograd : Srpsko hemijsko društvo", journal = "Journal of the Serbian Chemical Society", title = "Synthesis of novel 2-(piperazino-1-yl-alkyl)-1H-benzimidazole derivates and assessment of their interactions with the D2 dopamine receptor", volume = "84", number = "9", pages = "925-934", doi = "10.2298/JSC181029104P" }
Penjišević, J., Andrić, D. B., Šukalović, V., Roglić, G., Šoškić, V.,& Kostić Rajačić, S.. (2019). Synthesis of novel 2-(piperazino-1-yl-alkyl)-1H-benzimidazole derivates and assessment of their interactions with the D2 dopamine receptor. in Journal of the Serbian Chemical Society Beograd : Srpsko hemijsko društvo., 84(9), 925-934. https://doi.org/10.2298/JSC181029104P
Penjišević J, Andrić DB, Šukalović V, Roglić G, Šoškić V, Kostić Rajačić S. Synthesis of novel 2-(piperazino-1-yl-alkyl)-1H-benzimidazole derivates and assessment of their interactions with the D2 dopamine receptor. in Journal of the Serbian Chemical Society. 2019;84(9):925-934. doi:10.2298/JSC181029104P .
Penjišević, Jelena, Andrić, Deana B., Šukalović, Vladimir, Roglić, Goran, Šoškić, Vukić, Kostić Rajačić, Slađana, "Synthesis of novel 2-(piperazino-1-yl-alkyl)-1H-benzimidazole derivates and assessment of their interactions with the D2 dopamine receptor" in Journal of the Serbian Chemical Society, 84, no. 9 (2019):925-934, https://doi.org/10.2298/JSC181029104P . .